โครงสร้างของโปรตีนที่เกิดจากโปรตีนที่มีโครงสร้างปฐมภูมิม้วนตัวเป็นเกลียวหรือเรียงตัวเป็นแผ่น โครงสร้างที่มีลักษณะบิดเป็นเกลียวซึ่งเกิดจากการสร้างพันธะไฮโดรเจนในสายพอลิเพปไทด์เดียวกัน เรียกว่า เกลียวแอลฟา ส่วนโครงสร้างมีลักษณะเป็นแผ่นซึ่งเกิดจากการสร้างพันธะไฮโดรเจนระหว่างสายพอลิเพปไทด์ที่อยู่คู่กัน เรียกว่า แผ่นพลีทบีต้า