พอลิเมอร์ของกลูโคสเรียงต่อกันเป็นสายยาวและมีการแตกแขนง ส่วนที่เป็นสายยาว
เกิดจากกลูโคสเชื่อมต่อกันด้วยพันธะไกลโคซิดิกแบบ α - 1,4 เหมือนกับอะไมโลส
ส่วนที่แตกแขนงเกิดจากกลูโคสเชื่อมต่อกันด้วยพันธะไกลโคซิดิกแบบ α - 1,6
อะไมโลเพกทินละลายน้ำได้ดีกว่อะไมโลส ทำปฏิกิริยากับสารละลายไอโอดีนให้สีม่วงแดง